Gloria Patrise Lado Pengarang Maslim As-singkily Dosen Pembimbing 2 Ike Septa F Muktiawati Penguji 1 Ermelinda D Meye Ketua Penguji Vinsensius M. Ati Penguji 2

ABSTRAK Penelitian dilakukan pada bulan September sampai dengan November 2020 dengan lokasi di Kawasan Ekosistem Esensial Pulau Rote, yakni Danau Peto, Ledulu, dan Lendoen. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui struktur komunitas makroinvertebrata dan untuk mengetahui klasifikasi kualitas perairan berdasarkan keberadaan makroinvertebrata dengan perhitungan Family Biotic Index (FBI). Jumlah total titik pengambilan sampel adalah 171 titik dengan perincian pada setiap danau berbeda sesuai ukuran luas masing-masing danau. Parameter fisik dan kimia yang diukur pada setiap titik pengambilan sampel meliputi pengukuran suhu, derajat keasaman, dan pengukuran salinitas. Struktur komunitas makroinvertebrata di KEE Pulau Rote menunjukkan keanekaragaman terkategori rendah dengan nilai rata-rata 1,14, kemerataan antar spesies relatif seragam dengan nilai berkisar antara 0,6-1,0, kriteria dominansi rendah dengan nilai rata-rata 0,40, dan pola distribusi bersifat berkelompok dan seragam. Secara keseluruhan, kualitas perairan berdasarkan keberadaan makroinvertebrata berdasarkan Family Biotic Index (FBI) tergolong baik untuk mendukung kelangsungan hidup makroinvertebrata di KEE Pulau Rote. Kata kunci: Struktur komunitas, Makroinvertebrata, Kualitas perairan