CASSANDRA ELLEONORA MARIA NAILIU Pengarang PUTRI PANDARANGGA Dosen Pembimbing 2 JAYUSMAN JOESOEF Dosen Pembimbing 1 Putri Pandarangga Penguji 1 Yeremia Yobelano Sitompul Penguji 2 JAYUSMAN JOESOEF Ketua Penguji

Penyakit Mulut dan Kuku merupakan salah satu penyakit yang menular antar hewan berkuku belah yang menyebabkan kerugian ekonomi yang sangat besar. Pengetahuan mengenai analisis filogenik Penyakit Mulut dan Kuku antar hubungan kekerabatan yang ada di Indonesia dan di dunia belum ada. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk membandingkan efektivitas vaksin dari serotip yang ada di Indonesia dan di negara lainnya dan apabila vaksinnya kurang efektif maka dengan adanya informasi mengenai patogenesa molekuler untuk bisa digunakan sebagai pengobatan dengan terapi molekuler. Metode yang digunakan dalam pembuatan patogenesis molekuler dengan cara mengumpulkan data dari berbagai review literatur yang tersedia pada mesin pencari (google scholar dan Pubmed) lalu dengan adanya website Biorender maka akan dibuatkan alur patogenesis molekuler yang kemudian diilustrasikan melalui format PNG. Penentuan jumlah data sebanyak 35 sekuens gen protein VP1 dari genbank NCBI dikumpulkan dengan format fasta lalu sekuens tersebut akan disejajarkan (aligning) dan dipangkas (trimming) menggunakan metode clustaIW multiple alignment pada software BioEdit kemudian pada software MEGA XI file tersebut akan disejajarkan lagi dengan tipe muscle dan file akan disimpan dengan format mega setelah itu membuat pohon filogenik dengan metode maximum likelihood dan model jukes-cantor. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa infeksi Picornavirus memiliki dua jalur sinyal yang mempengaruhi imunitas bawaan yaitu TLR3 dan TLR7/8 dan reseptor RIG-I dan MDA-5. Jalur sinyal pertama menginduksi kompleks protein lalu memfosforilasi adaptor protein agar mengaktifkan sitokin proinflamatori sedangkan jalur sinyal kedua menginduksi IFNαβ melalui jalur STAT ½ untuk distimulasi dengan IFN sehingga menghasilkan beberapa ISGS (Interferone Stimulated Genes) yaitu OAS1, PKR dan Mx1. Negara Indonesia memiliki kedekatan genetik dengan negara Palestina, Afganistan, Turki dan Brasil dengan serotip yang sama yaitu serotip O. Pengetahuan ini dapat digunakan dalam pengembangan vaksin untuk pembentukan protective antybody yang bisa digunakan sebagai pengobatan dengan terapi molekuler. Kata kunci : Penyakit Mulut dan Kuku, Patogenesis, Filogenik, Protein VP1, PRR, Interferon, ISGS, Innate immunity.