GYAN CARLO VALENTINO YUSUF Pengarang MARCELIN DJ RATOE OEDJOE Dosen Pembimbing 1 NICODEMUS DAHOKLORY Dosen Pembimbing 2 Marcelin Dj Ratoe Oedjoe Ketua Penguji Nicodemus Dahoklory Penguji 1 Yudiana Jasmanindar Penguji 2

Teripang pasir (Holothuria scabra) merupakan salah satu spesies dengan nilai ekonomi tinggi yang tersebar di wilayah perairan tropis, termasuk Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies H. scabra secara genetik di Pulau Buaya (Alor) dan Pulau Seraya (Labuan Bajo) menggunakan pendekatan DNA barcoding pada gen Cytochrome Oxidase I (COI). Metode yang digunakan meliputi ekstraksi DNA, amplifikasi gen COI melalui PCR, elektroforesis, sekuensing, dan analisis filogenetik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa keempat sampel dari kedua lokasi memiliki urutan basa sepanjang 683 bp dan tingkat kemiripan sebesar 99,12% terhadap referensi H. scabra (NC_027086.1). Analisis pohon filogenetik mengelompokkan seluruh sampel dalam satu klade dengan nilai bootstrap 100, menunjukkan bahwa sampel berasal dari spesies yang sama. Temuan ini menunjukkan bahwa populasi H. scabra di kedua lokasi bersifat monomorfik secara genetik. Penelitian ini memberikan dasar ilmiah penting untuk pengelolaan budidaya dan konservasi berkelanjutan teripang pasir di Indonesia. Kata kunci: Holothuria scabra, DNA barcoding, gen COI, identifikasi genetik, konservasi