Skripsi
Pemodelan Farmakofor Senyawa Kimia Yang Memodulasi Protein Reseptor Asam Lemak Bebas FFAR4/GPR120 Sebagai Target Desain dan Pengembangan Obat Diabetes
- Bagikan:
Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengetahui fitur-fitur farmakofor yang didapatkan dari ligan-ligan yang diketahui aktif berinteraksi dengan target protein FFAR4/GPR120 struktur 3D, Untuk mengetahui karakteristik senyawa kimia baru yang didapatkan berdasarkan virtual screening dari model farmakofor ligan-ligan aktif, dan untuk mengetahui energi afinitas, pose/konformasi 2D/3D, ADMET (Adsorbsi, Distribusi, Metabolisme, Ekskresi, Toksisitas) dari 10 terbaik senyawa kimia baru berdasarkan interaksinya dengan protein target FFAR4/GP120. Pemilihan senyawa-senyawa yang aktif berinteraksi dengan FFAR4/GPR120 di dapat dari data base ChEMBL sebanyak 558 senyawa kimia. Untuk mendapatkan 10 senyawa kimia yang menunjukkan korelasi antara struktur dan aktivitasnya yang ditunjukkan dengan nilai EC50 dilakukan dengan analisis scaffold. Analisis farmakofor dari ke 10 senyawa aktif ini dilakukan untuk mengidentifikasi senyawa-senyawa baru di database. Hasil analisis diperoleh bahwa skor farmakofor paling tinggi yaitu 56,074 dari hasil penjajaran ke 10 struktur senyawa aktif dimana fitur-fitur yang dimiliki adalah 2 aromatik, 2 hidrofobik, 4 akseptor dan 1 atom bermuatan negative. Fitur-fitur farmakofor ini kemudian digunakan sebagai input (query) untuk mencari senyawa-senyawa kimia baru di database ZINC. Selanjutnya dilakukan virtual screening hasil
analisis interaksi 2D menunjukkan bahwa senyawa kandidat 000256027776 yang mempunyai energi interaksi paling tinggi -8,7 kkal/mol dan senyawa 000224977332 energi interaksinya rendah -6,3 kkal/mol. Hasil yang memiliki afinitas paling tinggi menunjukkan interaksi dengan residu-residu penting di kantong pengikatan protein reseptor FFAR4/GPR120 seperti interaksi hidrogen dengan Arg 99 dan interaksi hidrofobik dengan Phe319, Ile300, Ile297, Phe115, Phe320 dan Trp104 dan jarak ikatan hidrogen yang terbentuk sebesar 2,4 Angstrom (A0) dan menunjukkan daya serap di usus yang relatif lebih rendah yakni 59.769% dibandingkan senyawa kandidat yang lain. Namun senyawa 000256027776 bukanlah susbtrat dari enzim CYP2D6 dan CYP34A yang berperan dalam membuang senyawa-senyawa asing (xenobiotic) di liver.
Kata kunci : Diabetes, Pemodelan Farmakofor, FFAR4/GPR120, dan ADMET
Detail Information
| Item Type | |
|---|---|
| Penulis |
Steven Yanterson Leo - Personal Name
|
| Student ID |
1506070123
|
| Dosen Pembimbing |
LUTHER KADANG - 196810151991031002 - Dosen Pembimbing 1
REINNER ISHAQ LERRICK - 197907032005011002 - Dosen Pembimbing 2 |
| Penguji |
Luther Kadang - 196810151991031002 - Ketua Penguji
Reinner Ishaq Lerrick - 197907032005011002 - Penguji 1 Dodi Darmakusuma - 197107021999031003 - Penguji 2 |
| Kode Prodi PDDIKTI |
47201
|
| Edisi |
Published
|
| Departement |
Kimia
|
| Kontributor | |
| Bahasa |
Indonesia
|
| Penerbit | UPT Perpustakaan Undana : Kupang., 2021 |
| Edisi |
Published
|
| Subyek | |
| No Panggil |
472.01 LEO P
|
| Copyright |
Individu Penulis
|
| Doi |