Skripsi
Analisis Filogenik dan Studi Patogenesa Molekuler African Swine Fever di Babi
- Bagikan:
African Swine Fever (ASF) merupakan penyakit infeksius yang menyerangbabi memiliki mortalitas 100% dan sebabkan kerugian ekonomi yang besar. Tujuanpenelitian ini untuk mengetahui kekerabatan ASFV asal Indonesia dan dunia danpengumpulan informasi pengetahuan secara komprehensif tentang mekanismerespon imun babi melawan saat terinfeksi ASF. Dengan menggunakan sekuens p72dari genebank NCBI, 42 sekuens dari benua Asia, Afrika dan Eropa digunakanuntuk membangun pohon filogenik. Software yang digunakan adalah softwareMEGA XI metode maximum likelihood dan metode Tamura-3 parameter dengan100 kali pengulangan. Akan tetapi, sebelumnya sekuens ini disejajarkan dandipotong menggunakan BioEdit. Data untuk mekanisme patogenesa molekulerdicari dengan kata kunci seperti African Swine Fever, ASFV, innate immunity.Gambaran mekanisme respon imun melawan infeksi virus dibuat menggunakanwebsite BioRender. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 2 sekuens asal negaraIndonesia tergolong ke dalam genotipe II yang memiliki kedekatan genetik dengangenotipe asal China, Vietnam, Georgia dan Timor Leste. Empat jalur respon imunbabi yang terinfeksi ASF, yaitu melalui TLR-3, TLR-4, TLR-9 dan cGAS. Keempatjalur tersebut akan merangsang pembentukan IFN tipe I dan II dan kemudianmenginduksi kerja Interferon Stimulating Genes (ISGs) melalui jalur JAK/STAT.Beberapa protein ASFV dapat menjadi penghambat dalam produksi IFN sepertiEP364R, C129R, MGF505-7R, P17, MGF505-3R, MGF360-11L, A137R, I1215L,E120R, M1249L, MGF360-14L, I329L, A52R, dan pI10L. Selain itu, proteinASFV juga menghambat jalur pembentukan ISG yaitu CD2V, MGF505-7R,MGF360-9L, I215L dan S273R. Hasil penelitian ini dapat digunakan sebagaipengetahuan dasar dalam pengembangan vaksin dan antiviral dengan pendekatanmolekuler.
Kata kunci: ASFV, Interferon, Interferon stimulating gene, Patogenesis, Pohon Filogeni.
Detail Information
| Item Type |
Skripsi
|
|---|---|
| Penulis |
Fransiska Aping Dangur - Personal Name
|
| Student ID |
2009010021
|
| Dosen Pembimbing |
PUTRI PANDARANGGA - 198308102010122003 - Dosen Pembimbing 1
Yeremia Yobelanno Sitompul - 19920417 201903 1 014 - Dosen Pembimbing 2 |
| Penguji |
Maria Aega Gelolodo - 198411222009122002 - Ketua Penguji
Putri Pandarangga - 198308102010122003 - Penguji 1 Yeremia Yobelano Sitompul - 199204172019031014 - Penguji 2 |
| Kode Prodi PDDIKTI |
54261
|
| Edisi |
Published
|
| Departement |
Kedokteran Hewan
|
| Kontributor | |
| Bahasa |
Indonesia
|
| Penerbit | UPT Perpustakaan Undana : Kupang., 2024 |
| Edisi |
Published
|
| Subyek | |
| No Panggil |
54.21 Dan A
|
| Copyright |
Individu Penulis
|
| Doi |